补充申请则呈现出另一幅图景，生效变更（CBE）补充申请逐年增加（2021 财年除外），需事先批准的补充申请（PAS）也呈每年增加趋势，如下图所示。补充申请的工作量显著增加，而 ANDA 申报数量下降。从根本上讲是有道理的，因为批准和上市的 ANDA 越多，潜在所需的变更的目标就越多。
受控函方面，2021 财年 FDA 收到了创纪录的 4009 封受控函。如下图所示，自 GDUFA 以来每年的受控函数量都大大增加。
根据美国 Lachman 咨询公司的 Robert Pollock 的看法，提交给 FDA 的受控函的持续增加反映了行业对做一些可能有点不同寻常的事情的风险规避态度，因为他们担心他们认为正确的事情可能不符合 OGD 的期望。较高数量的受控函也可能反映了要么 FDA 误解了行业的受控函，要么 FDA 给出的答复不完整或实际上没有回答问题，从而导致行业对同一问题进行第二次或第三次受控函问询。Pollock 举例指出，“我熟悉的一家公司需要六封受控函来解决在我看来一个相当简单的问题。当出现混乱时，需要有一个更有效的受控函反馈系统，希望 GDUFA III 的改进有助于解决这个持续存在的问题。”
